Een reeks macabere moorden brengen Lara in conflict met een lugubere Alchimist uit het verleden en met een mysterieuze alliantie van invloedrijke personages. In het centrum van dit conflict bevinden zich de Obscura Paintings, een reeks van 5 schilderijen uit de 14de eeuw die de Alchimist opnieuw in z'n bezit wil krijgen. Beschuldigd van de moord op haar vroegere eenmalige mentor Von Croy moet Lara op de vlucht. Met de politie op haar hielen moet ze op zoek naar de Alchimist. Hierbij komt ze terecht in een wereld van intriges, bedrog en wraak waarbij ze de profane alliantie zal moeten verslaan en voorkomen dat ze hun duivelse krachten loslaten op de wereld.